现代化错综复杂的商业环境中，企业不仅面临激烈的市场竞争压力，还需应对复杂多变的资源环境挑战。在此形势下，基于中国特色现代企业制度的内部审计与公司治理协同发展机理的不断被发现和被揭示，将突破企业制度改革深层次的体制机制障碍，促进企业的健康可持续发展。中国特色现代企业制度框架下的内部审计与公司治理协同发展指标体系，可采用线性加权法测度二者协同发展指数，通过耦合协同评价模型测度二者耦合协同程度，并纳入内部审计与公司治理耦合协同发展的影响因素。研究发现：其一，2012-2022年间，中国特色现代企业制度下内部审计与公司治理的耦合协同度呈现“降中有升”的波动上升态势，从低度协同发展至高度协同，而2016年深化国有企业审计监督的政策是其关键的转折点；其二，专业胜任能力是影响二者协同发展的最强驱动因素，其重要性随时间持续提升；其三，政府需求、公众需求及内部审计的独立性都是显著影响因素，其中政府需求的影响力随时间有所减弱，而公众需求与独立性交互作用强；其四，企业产权性质与持股比例对协同发展的影响相对较弱，但与其他因素（如独立性、专业能力）存在显著的交互效应。